Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EBAG9O00559 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms