Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms