Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms