Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms