Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID3CA6NKF2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms