Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAN1Q9Y2M0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms