Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXD3Q9UJU5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms