Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH4Q9UIA0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CYTH4Q9UIA0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms