Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFMBT1Q9UHJ3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms