Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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