Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9Q9P2J2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGSF9Q9P2J2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms