Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP36Q9P275 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms