Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms