Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PODXL2Q9NZ53 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms