Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms