Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC4Q9NTJ3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms