Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms