Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms