Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY9Q9HBG7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms