Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms