Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUS3Q9BZE2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms