Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms