Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms