Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms