Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms