Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms