Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms