Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXPE2Q96DL1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms