Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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