Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms