Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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