Protein–RNA interactions for Protein: Q86XM0

CATSPERD, Cation channel sperm-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERDQ86XM0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPERDQ86XM0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms