Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NANOGNBQ7Z5D8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGNBQ7Z5D8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms