Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms