Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms