Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPGS1Q6ZTW0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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