Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A10Q6U841 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A10Q6U841 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms