Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF7Q6Q0C0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms