Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms