Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPI1

CTRB2, Chymotrypsinogen B2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB2Q6GPI1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB2Q6GPI1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms