Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms