Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms