Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGSNQ5TDP6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms