Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP188Q5SRE5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP188Q5SRE5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms