Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms