Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms