Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO43Q4G163 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO43Q4G163 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms