Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC153Q494R4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms