Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP27-1Q3LI81 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP27-1Q3LI81 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms