Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LETM2Q2VYF4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms